Bibliographie
Tous les schémas avec la mention "réalisé par" ont été créé sur le site BioRender.com, un outil très pratique et complet pour réaliser des schémas en biologie..
Partie sur le microbiote intestinal :
Espèces et niches écologiques
https://hal.inrae.fr/hal-02637241/document
https://www.spo-dz.com/wp-content/uploads/youzer/file_5df350e824bf3.pdf
​
Mise en place
Imprinting of the immune system by the microbiota early in life | Mucosal Immunology (nature.com)
​
Etudier le microbiote
http://www2.cnrs.fr/sites/communique/fichier/cp_fibres_ileon.pdf
http://thesesante.ups-tlse.fr/2231/1/2018TOU32040.pdf
https://www.youtube.com/watch?v=MgV-s6HlRdQ
https://dridk.me/metagenomique.html
http://www.orthodiet.org/fr/metagenomique-la-revolution-dans-le-monde-biomedical-2
​
Cas de dysbiose
​http://thesesante.ups-tlse.fr/2231/1/2018TOU32040.pdf
https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/j.1365-2672.2007.03400.x
https://www.spo-dz.com/wp-content/uploads/youzer/file_5df350e824bf3.pdf
​
Escherichia coli
Escherichia coli (ou E. coli) - Gut Microbiota for Health
​
​​
Partie sur le système digestif :
Généralités sur la digestion
Cours d’SVT de Olivier Gomila, Lycée Pierre d’Aragon
https://www.youtube.com/watch?v=OI2Ja1n8mks
https://www.futura-sciences.com/sciences/definitions/chimie-enzyme-710/
http://ohayon.lucie.free.fr/articles.php?lng=fr&pg=623
​
Dégradation des fibres alimentaires
https://hal.inrae.fr/hal-02637241/document
https://fr.wikipedia.org/wiki/R%C3%A9seau_trophique#Caract%C3%A9ristiques_g%C3%An%C3%A9rales
https://definition-simple.com/chaine-trophique/
https://fr.wikipedia.org/wiki/Microbiote_intestinal_humain#%C3%89cologie_et_composition
https://fr.wikipedia.org/wiki/H%C3%A9micellulose
http://thesesante.ups-tlse.fr/2231/1/2018TOU32040.pdf
https://diabetnutrition.ch/les-macronutriments/les-lipides/les-lipides/la-digestion-des-lipides/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4235735/
http://www.chups.jussieu.fr/polys/biochimie/LLbioch/POLY.Chp.3.11.html
​
Absorption des nutriments
https://ressources.unisciel.fr/biocell/chap2/co/module_Chap2_5.html
https://diabetnutrition.ch/les-macronutriments/les-lipides/les-lipides/la-digestion-des-lipides/
https://fr.slideshare.net/longbong/15-digestion-absorptionlipides
​
Acides gras à chaîne courte
http://thesesante.ups-tlse.fr/2231/1/2018TOU32040.pdf
https://hal.inrae.fr/hal-02637241/document
https://www.luxia-scientific.com/fr/blog/le-butyrate
https://www.santescience.fr/butyrate/
​
Epithélium
https://sites.google.com/site/coursbiologieanimale/histologie/chapitre-1-epitheliums-de-revetement
https://ressources.unisciel.fr/biocell/chap2/co/Chap2_webUnisciel.html
​​
Partie sur le système immunitaire :
Cours de M.Kramer, Université de Bordeaux
​
​
​
​
​
​
Réponses aux agents pathogènes :
Différenciation lymphocytaire B normale - ScienceDirect
Cours de SVT de M.Grasset, Lycée Jeanne D'Arc
Définition | Immunoglobuline | Futura Santé (futura-sciences.com)
Thèse d'Emilie Dolié : Rôle de la flore intestinale dans l’immunité : usage actuel des probiotiques et futures indications Université Toulouse III
​
Role of intestinal microbiota and metabolites on gut homeostasis and human diseases (nih.gov)
Thèse d'Emilie Dolié : Rôle de la flore intestinale dans l’immunité : usage actuel des probiotiques et futures indications Université Toulouse III
​
Les sécrétions du microbiote :
Interaction between the gut microbiome and mucosal immune system (nih.gov)
Thèse d'Emilie Dolié : Rôle de la flore intestinale dans l’immunité : usage actuel des probiotiques et futures indications Université Toulouse III
Partie sur le système nerveux :
-
Collins J, Borojevic R, Verdu EF, Huizinga JD, Ratcliffe EM. Intestinal microbiota influence the early postnatal development of the enteric nervous system.
-
Wall R, Cryan JF, Ross RP, Fitzgerald GF, Dinan TG, Stanton C. Bacterial neuroactive compounds produced by psychobiotics. Adv Exp Med Biol 817: 221–239, 2014.
-
De Vadder F, Grasset E, Mannerås Holm L, Karsenty G, Macpherson AJ, Olofsson LE, Bäckhed F. Gut microbiota regulates maturation of the adult enteric nervous system via enteric serotonin networks. Proc Natl Acad Sci USA 115: 6458 – 6463, 2018
-
https://yestherapyhelps.com/enteric-nervous-system-parts-and-functions-15120
-
Erny D, Hrabe˘ de Angelis AL, Jaitin D, Wieghofer P, Staszewski O, David E, KerenShaul H, Mahlakoiv T, Jakobshagen K, Buch T, Schwierzeck V, Utermöhlen O, Chun E, Garrett WS, McCoy KD, Diefenbach A, Staeheli P, Stecher B, Amit I, Prinz M. Host microbiota constantly control maturation and function of microglia in the CNS. Nat Neurosci 18: 965–977, 2015. doi:10.1038/nn.4030
-
Bohórquez DV, Samsa LA, Roholt A, Medicetty S, Chandra R, Liddle RA. An enteroendocrine cell-enteric glia connection revealed by 3D electron microscopy. PLoS One 9: e89881, 2014. doi:10.1371/journal.pone.0089881
-
Asano Y, Hiramoto T, Nishino R, Aiba Y, Kimura T, Yoshihara K, Koga Y, Sudo N. Critical role of gut microbiota in the production of biologically active, free catecholamines in the gut lumen of mice. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol 303: G1288 –G1295, 2012. doi:10.1152/ajpgi.00341.2012
-
Clarke G, Grenham S, Scully P, Fitzgerald P, Moloney RD, Shanahan F, Dinan TG, Cryan JF. The microbiome-gut-brain axis during early life regulates the hippocampal serotonergic system in a sex-dependent manner. Mol Psychiatry 18: 666 – 673, 2013. doi:10.1038/mp.2012.77
-
Arentsen T, Qian Y, Gkotzis S, Femenia T, Wang T, Udekwu K, Forssberg H, Diaz Heijtz R. The bacterial peptidoglycan-sensing molecule Pglyrp2 modulates brain development and behavior. Mol Psychiatry 22: 257–266, 2017. doi:10.1038/mp. 2016.182.
-
John F Cryan 1, Kenneth J O'Riordan 1, Caitlin S M Cowan 1, Kiran V Sandhu 1, Thomaz F S Bastiaanssen 1, Marcus Boehme 1, Martin G Codagnone 1, Sofia Cussotto 1, Christine Fulling 1, Anna V Golubeva 1, Katherine E Guzzetta 1, Minal Jaggar 1, Caitriona M Long-Smith 1, Joshua M Lyte 1, Jason A Martin 1, Alicia Molinero-Perez 1, Gerard Moloney 1, Emanuela Morelli 1, Enrique Morillas 1, Rory O'Connor 1, Joana S Cruz-Pereira 1, Veronica L Peterson 1, Kieran Rea 1, Nathaniel L Ritz 1, Eoin Sherwin 1, Simon Spichak 1, Emily M Teichman 1, Marcel van de Wouw 1, Ana Paula Ventura-Silva 1, Shauna E Wallace-Fitzsimons 1, Niall Hyland 1, Gerard Clarke 1, Timothy G Dinan 1, The licrobiota gut brain axis, Physiol Rev 99: 1877–2013, 2019 Published August 28, 2019; doi:10.1152/physrev.00018.2018,